04.09.2013 Paris

Référence au site des statistiques moléculaires de E.Coli.    Si l'eau est contrôlée dès son entrée dans la cellule et qu'elle relie comme une flèche les anions et les cations, les aas avec leur pince zwitterionique doivent guider les protéines par leurs radicaux hydrophiles qui se trouvent à l'extérieur de la protéine et dont les fonctions chimiques,  comme je l'ai dis dans ref., sont les mêmes que la tête ( et même presque comme une pince avec les 2 aas amides), favorisant les liaisons hydrogènes.

Il y a 6 millions d'aas libre soit l'équivalent de 20 000 proteines de 300 aas.

Il y a 1 million de protéines libres de 360 aas (hors ribosomes) : soit 6 aas par protéines. Un nombre qui aurait une influence pour le guidage des protéines serait de 60 aas (un facteur de transcription) soit pour 10% des protéines libres.

il y a ~ 1 millions de protéines ribosomiques (de 130 aas par proteines en moyenne).

Il y a 200 000 protéines membranaires (membrane cytoplasmique).

Il y a 100 000 protéines nucléaires.

Tableau numérique (feuille4): aas libres en 10 000

Rôles des aas libres:

1. Réserve: réponse rapide pour synthétiser une protéine. Il n'y a que 200 000 tRNA/cell.
2. Guidage: pour le convoyemment des facteurs de transcription ou autres protéines grâce à 5 aas: STYDE représentent 50% des aas libres.
3. Groupage en pseudo-peptide comme l'hypothèse de l'initialisation du métabolisme à partir des têtes hydrophiles de la membrane.
4. Chélation des ions métaliques en pseudo-enzymes ou tout simplement transport pour protéger l'environnement de l'action de ces ions. Il n'y a que 5 métaux de transition représentés dans ces statistiques: Fe   7 millions    Zn Cu Mo Mn  1,7 millions chacun. Pourquoi le Mo? En comparaison Ca 2,4 millions dont la presque totalité est chélatée (par les protéines?) et Mg 4 millions (libres?).
5. Transport par chélation faible des produits et substrats des réactions enzymatiques pour les protéger de l'eau.
6. La thréonine serait
• une réserve pour la synthèse de LIVG: G+acétaldéhyde  <---> T  ----> LIV.
• Un meilleur guidage des protéines: liaison hydrogène avec OH et en même temps le méthyl pour l'hydrophobie.
• Une meilleure chélation des produits et substrats des réactions enzymatiques: liaison hydrogène avec OH et en même temps le méthyl pour l'hydrophobie.