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Top articles
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Résonance et dimension
Paris le 05.02.24 Comment la résonance peut s'effectuer dans une dimension? Par exemple une corde ou un brin d'ADN. La forme circulaire est la plus adaptée. Parce que dans un fil elle va se manifester sur un segment et plus le fil est long plus elle sera...
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Un délire d'ADN: la création de gènes
21.8.19 Paris Voir Un délire d'ADN: Le labyrinthe 16.9.19 Paris Je vais lister les idées qui ont émergées depuis l'étude des tRNAs. Cela ne sera pas dans l'ordre ni définitif, mais c'est pour fixer ces idées tout en continuant par ailleurs à rentrer dans...
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Un délire d'ADN: Le labyrinthe
21.8.19 Paris Un délire d'ADN ou la création des gènes. A partir des annotations de NCBI chez les bactéries, j'ai recensé les opérons puis les clusters 16s-aas-CDS-23s-5s-aas. Avec les opérons d'E.Coli associant gène de tRNA et protéines et les caractéristiques...
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Un polypeptide à un seul acide aminé
11.8.17 Paris Il y a une contradiction dans ce titre et c'est voulu. L'idée est venue à la suite de l'étude des tRNAs: Un tRNA correspondrait à un gène protéique avec les extrémités 3'-UTR et 5'-UTR nécessaires à la transcription et ne contenant qu'un...
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Chronologie des écrits
Mise en ligne ce jour 3.2.16 Paris Chronologie des écrits dans blogooolife Par date Par dossier ordre dates début fin titre ordre dates début fin titre 9.0806 6.8.09 20.4.11 Abiogénèse expérimentale note2 13.0904 4.9.13 4.9.13 Les aas libres comme lubrifiant...
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Le gradient du vivant
8.1.14 Paris Le, puisque je penses que ça soit l'unique gradient qui sous-tend l'évolution moléculaire. Ce gradient est le passage de l'hydrophobicité à l'intrication électronique de l'ADN, en passant par les liaisons ioniques et les liaisons hydrogènes....
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Polymérisation panachée R dR
18.12.13 Paris Suite à la réflexion sur le détricotage du vivant et de la polymérisation des nucléotides il est apparue une idée d'expérimentation pour les débuts de l'évolution moléculaire: est-ce qu'on peut panacher R et dR (ribose et désoxyribose)...
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Synthèse d'étape 2: Pression hydrostatique
Rappel des chantiers sur les HP hydrostatiques en cours. 10.12.2012 Chiralité notes. eldik 2002. HP vésicules géantes. geomicrobiology HP 2010. Chimie verte. Les lipides W. Christie, Chevreul. Les dipoles des PLD. Nanotechnologies liquides. chimie liquide...
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Zéolithes
C'est une des 4 idées pour l'origine du pétrole abiotique. L'idée vient de 3 constatations: Les zéolithes sont utilisés dans l'industrie comme de puissants catalyseurs pour la production de pétrole synthétique. Ils se forment en grande quantité dans les...
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Le stress enzymatique
26.8.17 Tanger La fonction enzymatique est constitutive de l'architecture biologique même et la rendre stressante n'aurait de sens que si on dévoile son caractère nocif au moins relativement. Ce caractère nocif relatif s'applique à l'ARN et non aux protéines...
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Résultats et discussion
23.5.16 Paris Résultats Le diagramme de chaque codon et aa, Le classement des codons et aa suivant les valeurs propres des matrices des corrélations Statistiques de la répétition des bases Discussion GC content versus corrélation entre codons et entre...
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Evolution de la membrane prébiotique
13.7.14 Kyoto Le speach de Pohorille m'a suggéré qu'il faut considérer la perméabilité des liposomes non pas d'un liposome parfait, mais d'un liposome formé à partir de la soupe prébiotique contenant dans la bicouche de nombreuses molécules qui la rendent...
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Protéines ribosomales
05.09.2013 Ribosome large A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y rplA 33 0 14 11 4 20 2 11 23 17 7 12 7 9 11 8 13 29 0 3 234 21 2 10 11 4 34 9 11 25 15 6 15 17 6 29 10 14 26 2 6 273 19 0 9 12 8 26 3 8 19 11 4 8 6 8 12 9 16 28 2 1 209 D 23 0 12 12 6 13...
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La continuité entre l'évolution moléculaire et l'évolution darwinienne
La continuité entre l'évolution moléculaire et l'évolution darwinienne 20.7.13 Paris Introduction Supposons qu'on ait décrit ou montré expérimentalement les différentes étapes du scénario pour passer du monde minéral au monde vivant. C'est ce que j'appelle...
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Synthèse d'étape 1: La chiralité prébiotique à l'épreuve de la pression hydrostatique .
version 1 du 26/7/12 Interprétation de la piesophilie trouvée dans la littérature. Giant vesicles:irréversibilité, peut-être liaison phosphoester. E.Coli inactivée, ne pousse plus mais peut s'activer avec le retour aux conditions favorables. * Pression...
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diagénèse des clathrates abiotiques
C'est une des 4 idées pour l'origine du pétrole abiotique: les clathrates formés notamment par les sources hydrothermales soumises à la diagénèse produiraient des molécules organiques sous l'effet des hautes pressions (jusqu'à 2-4 kbars) mais à des températures...
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Journal intime de la réflexion
30.12.18 Paris Par réflexion j'entends ma réflexion sur les PEEMOVs que j'ai entreprise déjà depuis 10 ans. Avec les articles sur la répétition des bases et la corrélation entre les codons protéiques je me suis tellement étalé et dispersé dans mes recherches...
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Concept dynamique/statique
21.9.16 Paris J'allais le titrer périplasme prébiotique. C'est en effet une réflexion qui n'est pas aboutie, voir la note du 28.5.14 dans concept global 2014, dans préparation. Mais ma réflexion sur le périplasme a recommencée en association avec l'article...
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Evolution par morceaux de la continuité évolutive
14.4.14 Paris Ceci concerne l'article de la continuité entre évolution moléculaire et darwinienne. L’évolution par morceaux fait allusion à la continuité par morceaux en mathématiques. Cette notion de continuité par morceaux n'est pas en contradiction...
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La famille des acides aminés codants
Ce sont les acides aminés qui sont utilisés pour la traduction. Pourquoi et comment seuls ces aas sont-ils sélectionnés pour la traduction? 6.2.14 Paris Le groupe des aas codants: On devrait dire qu'il y en a 21 à 23, car la fMet est un aa codant et possède...
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Les aas libres comme lubrifiant
04.09.2013 Paris Référence au site des statistiques moléculaires de E.Coli. Si l'eau est contrôlée dès son entrée dans la cellule et qu'elle relie comme une flèche les anions et les cations, les aas avec leur pince zwitterionique doivent guider les protéines...
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Longueur des aa
21.05.2013 Pourquoi les aa's sont courts? Une hypothèse: en formant une boucle alpha dans la membrane, les radicaux étant à l'extérieur de la boucle, ils s'accrochent à 1 seule molécule de PLD pour laisser les autres PLD circuler. hydrophobicité fon gly...
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Les forces fondamentales
14.12.12 documentaire matière noire, Arte 13.12.12. Par rapport à ma réflexion sur la dualité gravitation/électromagnétisme je rapporte ici les phénomènes astronomiques qui ne s'expliquent pas par la théorie physique en cours. Ce documentaire rapporte...
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Les fondements de l'évolution moléculaire prébiotique
scenario du 15/6/12 PréfaceIntroduction Plan Problématique évolution moléculaire: enzyme minimale, pétrole, liposome, chimio-osmose, chiralité L'électromagnétisme et les démons de Maxwell La gravitation et la mécanique quantique La force nucléaire et...
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Marériel et méthodes
23.5.16 Paris Le choix des bactéries, Les bases de données utilisées, Les moulinettes en Perl pour la compilation et Les types de compilations choisis, Les protéines à étudier, Les diagrammes et les courbes de tendance, Les coefficients de corrélation,...