Publié le 27 Février 2016

27.02.16 Paris ## Perl pour compter les codons d'un ensemble de protéines pour plusieurs organismes.## Les noms des organismes (@noms) sont ceux de KEGG. Les protéines sont extraits de KEGG au format 60 caractères, mises chacune dans un fichier txt (sans...

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Publié le 27 Février 2016

17.11.15 Paris Programme en perl pour compter les bases répétées #!/usr/local/bin/perl mekki 17.11.15 Comptage de séquences de bases répétées## Résultat: KEGG donne 4 641 652 paires de bases. Chercher dans organismes de KEGG eco (Escherichia Coli).##3...

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Publié le 27 Février 2016

27.02.16 Paris # Comptage, par aléa, des répétitions de bases pour un %GC donné.# 3 paramètres à changer ici sur la 1ère ligne et sauvegarder avant d'exécuter le programme dans un terminal.# exemple compter les répétitions pour un %GC de 17/46=36.9% et...

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Publié le 24 Février 2016

24.02.16 Paris Tableaux faits avec le programme "Perl codons: m protéines n organismes" . 1. Tableau 1 : codon-usages des DNA, RNA polymérases et des A minoacyl-tRNA synthetases 111 bactéries Tableaux: 1 1/3 : Leu Lys Phe Pro Val Thr 2/3 : Ser Tyr Asn...

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Publié le 3 Février 2016

Mise en ligne ce jour 3.2.16 Paris Chronologie des écrits dans blogooolife Par date Par dossier ordre dates début fin titre ordre dates début fin titre 9.0806 6.8.09 20.4.11 Abiogénèse expérimentale note2 13.0904 4.9.13 4.9.13 Les aas libres comme lubrifiant...

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