Blog on origin of Life . . . Premières Etapes de l'Evolution Moléculaire à l'Origine de la Vie

23.5.16 Paris Il s'agit dans un premier temps d'accumuler des références au fur et à mesure de leur rencontre, et de les classer par thèmes.

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23.5.16 Paris Résultats Le diagramme de chaque codon et aa, Le classement des codons et aa suivant les valeurs propres des matrices des corrélations Statistiques de la répétition des bases Discussion GC content versus corrélation entre codons et entre...

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23.5.16 Paris Le choix des bactéries, Les bases de données utilisées, Les moulinettes en Perl pour la compilation et Les types de compilations choisis, Les protéines à étudier, Les diagrammes et les courbes de tendance, Les coefficients de corrélation,...

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23.5.16 Paris Beaucoup de travaux ont été faits sur le contenu en GC de l'ADN depuis les années 1950. L'aspect physique de l'ADN y est abordé mais pas du point de vue résonance comme je l'ai fait dans le concept global.

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23.5.16 Paris Comment je suis arrivé à étudier le contenu en GC de l'ADN dans ma réflexion sur les origines de la vie. Cela sera l'introduction et la définition du cadre de l'article à publier sous le titre de "les états vibratoires de l'ADN et la sélection...

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27.3.16 Paris "voir introduction du même titre dans La croissance prébiotique le 5.2.16." Cet article va traiter du contenu en GC de l'ADN. Mais provisoirement je consigne ces idées émanées pendant les travaux de compilation sur le contenu en GC ( voir...

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27.02.16 Paris ## Perl pour compter les codons d'un ensemble de protéines pour plusieurs organismes.## Les noms des organismes (@noms) sont ceux de KEGG. Les protéines sont extraits de KEGG au format 60 caractères, mises chacune dans un fichier txt (sans...

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17.11.15 Paris Programme en perl pour compter les bases répétées #!/usr/local/bin/perl mekki 17.11.15 Comptage de séquences de bases répétées## Résultat: KEGG donne 4 641 652 paires de bases. Chercher dans organismes de KEGG eco (Escherichia Coli).##3...

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27.02.16 Paris # Comptage, par aléa, des répétitions de bases pour un %GC donné.# 3 paramètres à changer ici sur la 1ère ligne et sauvegarder avant d'exécuter le programme dans un terminal.# exemple compter les répétitions pour un %GC de 17/46=36.9% et...

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24.02.16 Paris Tableaux faits avec le programme "Perl codons: m protéines n organismes" . 1. Tableau 1 : codon-usages des DNA, RNA polymérases et des A minoacyl-tRNA synthetases 111 bactéries Tableaux: 1 1/3 : Leu Lys Phe Pro Val Thr 2/3 : Ser Tyr Asn...

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