27/07/12

• Différentiel de pression nul à travers la membrane: non documenté. Est-ce une hypothèse?
• Aux HHP la bicouche devient rapidement imperméable à l'eau et à d'autres molécules!
• * R.Winter, C.Jeworrek, 2009. Effect of pressure on membranes. Soft Mat. 5:3157-3173.
• * article à récupérer à l'UPMC.

• Stabilisation du double brin de l'ADN rendant la réplication et la transcription impossible.
  • * R.B.Macgregor 2002: The interactions of nucleic acids at elevated hydrostatic pressure. Biochim. Biophys. Acta 1595: 266.276.
• Pour une adaptation non génétique à la pression pour les protéines il introduit les osmolytes (ligne 326). C'est très documenté et prouvé pour les stress osmotiques et thermiques mais peu et non concluant pour les HHP. Liste longue des osmolytes. Ligne 361:"nous avons très peu de données concernant les solutés qui contrecarrent les effets des hautes pressions".
  • * Kelly R.H., Yancey P.H., 1999. High contents of trimethylamine oxide correlating with depth in deep-sea telost fishes, skates, and decapod crustaceans. Biol. Bull. 196: 18-25.
• Il n'y a pas un protocole clair qui définit l'expérience in-vitro pour comparer le comportement de l'adaptation (protéines et ribosomes) entre la cellule vivante, le liposome contenant les seuls réactants nécessaires, et ces réactants en solution sans liposome.
• Stabilité des ribosomes.
• Inactivation d'E.Coli. voir Table 1 ligne 434.     voir ces artclies:    
• 2002     Role of Membrane Fluidity in Pressure Resistance of Escherichia coli NCTC 8164. M. A. Casadei et al.; APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Dec. 2002, p. 5965–5972  Vol. 68, No. 12; 0099-2240/02/.00+0 DOI: 10.1128/AEM.68.12.5965–5972.2002
  Copyright © 2002, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.
• 2004    Morphological and Physiological Changes Induced by High Hydrostatic Pressure in Exponential- and Stationary-Phase Cells of Escherichia coli: Relationship with Cell Death. Pilar Manas et al.; APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Mar. 2004, p. 1545–1554; Vol. 70, No. 3. 
  0099-2240/04/.00+0 DOI: 10.1128/AEM.70.3.1545–1554.2004. Copyright © 2004, American Society for Microbiology. All Rights Reserved.
• Respiration et transports (OmpH/L) comme Aix-Marseille-II.
• Adaptation fine par réglage des processus existants.
• Adaptation propre aux piezophiles vrais (ligne 199). Voir Table 2 ligne 437. Ces marqueurs servent à déterminer les procaryotes autochtones (pétrole? Ligne 208).
• Disparition de certaines fonctions chez les piezophiles vrais. Exemple réparation de l'ADN (ligne 212). Est-ce une simplification qui nous rapproche de LUCAS?
  • * Camparano et al 2005 (bacteries), Gunbin et al 2009 (archées)
• Erreur: Methanocaldococcus jannaschii est une archée méthanogène et non méthanotrophe