C'est une des 4 idées pour l'origine du pétrole abiotique: les clathrates formés notamment par les sources hydrothermales soumises à la diagénèse produiraient des molécules organiques sous l'effet des hautes pressions (jusqu'à 2-4 kbars) mais à des températures relativement faibles, entre 2°C et 150°C, par rapport à celles des processus industriels supérieures à 200°C.